Я так понял, что речь идёт об обычном сканере для бумаги, только вместо бумаги ложишь проявленую плёнку. На сканерах есть функция сканирования негативов. Советую также увеличить число точек на инч, потому что кадр очень маленький. Даже если нет функции для негативов, можно всегда сделать инверсию в Фотошопе.