грибы могут расти и не на растительном субстрате, некоторые грибы могут расти числом в растворах орг. веществ - дрожжевая фаза)
Откуда это органические вещества берутся?
Да и вообще, при чём тут грибы? Что Вы можете грибами доказать или опровергнуть?
вот моя версия - грибы появились одновременно (по-крайней мере в пределах одного дня с растениями).
В пределах одного Божьего дня - вполне возмножно.
Бог изначально приготовил почву для растений, животных, грибов и т.д. и в течении 4-х дней (вполне реальный срок для сохранения качественных для экосостемы свойств) заселил землю. Чем эта версия хуже эволюционистской?
Это версия, не подтверждённая текстом Библии. Так что она - просто чья-то версия.
1)молекулярная масса аммиака (около 17) еще меньше, чем молекулярная масса азота (28) и меньше молекулярной массой воды (18). Следовательно, аммиак испарился бы даже раньше воды и тем более азота.
Во-первых, аммиак, по-видимому, выделяется в процессе вулканической активности.
Во-вторых, Вы правы, в конце концов аммиак действительно исчез из нашей атмосферы.
2)аммиак является токсичным веществом не помню какого класса опасности, и даже его остатки в атмосфере загнули бы всю жизнь.
Нет. Напротив, он, видимо, был необходимым "строительным материалом" для первых живых организмов.
Кислород ведь тоже многие биохимические процессы "загибает", говорят даже, что из-за него мы быстрее стареем. 
Но их эксперименты с треском провалились по разным причинам
Думаю, главная причина состоит в том, что жизнь возникла лишь однажды и после этого Бог уже не допускает повторного её зарождения.