Мудрый пастор, реально спорить - бесполезное занятие.
Лучше общаться в форме диалога, уважительно к мнению атеиста, шатать основание - задавать вопросы, которые ставят под сомнения разные теории.
Потом человеку будет интересно твое мнение - спросит, вот тогда можно понемногу рассказать не перегружая фактами. Нужно молиться, и искать где можно послужить, куда Дух Святой поведет.
Конечно, если Господь не коснеться сердца человека - бесполезно.